Электрофоретическое разрешение. В идеале детектор — это средство визуализации процесса разделения, проходящего в капилляре, не оказывающее влияния на качество разделения. Электрофоретическое разрешение должно определяться только процессом разделения в капиллярном канале; присутствие детектора может либо ухудшить, либо в лучшем случае не повлиять на разрешение. В идеале длина детектирования должна составлять только некоторую часть ожидаемой ширины самых узких зон, мигрирующих по капилляру, во избежание расширения полос детектором. Характеристики детектора (уровень шума и/или величина выходного сигнала) часто улучшаются при увеличении длины детектирования. Однако ожидаемые электрофоретические эффективности и, следовательно, ширина зон в системе КЭ общего применения сильно варьируют от применения к применению. В результате область детектирования обычно устанавливается равной 10 % от ожидаемой ширины самой узкой из возможных зон, а разрешение соответствует требованиям, предъявляемым к разделению, за счет чувствительности. Приводимый ниже пример иллюстрирует один из методов оценивания минимально допустимой длины детектирования. Абсолютная минимальная дисперсия пика для любого разделения определяется расширением, вызванным только продольной диффузией:
Поэтому допустимая длина детектирования будет 140 мкм. Хотя данный анализ упрощен (в приведенном расчете инжекционная дисперсия принимается равной нулю, рассматривается только один механизм размывания зон), он показывает, что для поддержания высокого разрешения должна обеспечиваться достаточно малая длина детектирования [1, 2]. Максимально допустимая длина детектирования для обычных оптических детекторов капиллярного электрофореза составляет приблизительно 100— 200 мкм.