Детектора для данной комбинации «анализируемое вещество/среда разделения» очень важен. Для этого достаточно измерить на спектрофотометре характеристики поглощения как среды разделения, так и растворенной в ней пробы. Использование излучения с длиной волны менее 200 нм оказалось удачным (хотя выбор буферных систем при этом ограничен) при работе с белками и другими биомолекулами [31]. Несколько сообщений было о моноволновой регистрации с использованием дифракционных решеток с быстрым сканированием или детекторов на диодных линейках [32, 33]. В работе [34] проводится сравнение детектора на диодной линейке и системы детекторов быстрого сканирования. Эти детекторы обеспечивают дополнительную оперативную спектральную информацию для идентификации анализируемых соединений при оценке чистоты пика или предварительном исследовании для определения оптимальных значений длины волны детектирования.